Муром окончательно утратил бывшую самостоятельность, попав под сильную Московскую власть. Таким образом, он стал пограничной крепостью Московского княжества, а его дружина участвовала во многих походах в составе московских войск. XVI век.

Походы московских князей.

С наступлением XVI века в Муроме начала налаживаться жизнь, но город по-прежнему оставался лишь окраиной государства. Великие князья начали ссылать сюда не желавших покориться новгородских бояр, которые не смирились с ослаблением своего рода. Таким образом, здесь жили многие крупные купцы-новгородцы, сюда сослали и сына довольно знаменитой Марфы-посадницы, Ф. Борецкого.

К этому времени на востоке таилась главная опасность для русского княжества в лице Казанского ханства. Частые набеги татар не давали покоя. Тогда еще молодой Иван IV совершил первый поход на Казань, который закончился неудачей. Через три года царь снова повел войска. Проведя в Муроме последнюю неделю подготовки войск, он обошел все имеющиеся святыни города с молитвами и тогда же дал обет застроить его монастырям и белокаменными храмами в случае победы.

После завершения победоносного похода Муром стал ее памятником, вмещая в себя огромный ряд шедевров архитектуры того времени, из которых на данный момент сохранились храмы Спасского монастыря и Козьмодамианская шатровая церковь. После наступления мира город преобразился, торговля начала развиваться быстрыми темпами.

В середине XVI века в Муроме развились превосходные мастера по выделке кож, кузницы, сапожники, ювелиры, определяя его как важный ремесленный центр. Также здесь неоднократно происходило собрание войск Ивана Грозного перед походом на Казань.

С приходом советского времени множество храмов города были разорены, а некоторые церкви XVI-XVII веков полностью снесены.